Mataram Utama FC merupakan pengembangan dari klub PS Manggala SIWO PWI yang merupakan anggota Askot PSSI Kota Yogyakarta.

Mataram Utama FC yang berkompetisi di Liga 3, berada di bawah naungan  PT Mataram Utama Manggala yang juga membawahi:

1.      Manggala SIWO Mataram Utama yang berkompetisi di Askot PSSI Kota Yogyakarta.

2.      Mataram Utama Football Academy

Didirikannya Mataram Utama FC berangkat dari keinginan memajukan sepakbola dengan hati berbasis pembinaan usia muda.

Mataram Utama Football Academy merupakan wadah yang terintegrasi dengan pembinaan pesepakbola usia muda di DIY dan sekitarnya.

Mataram Utama Football Academy memiliki tiga jenjang kelompok usia yakni Kelas Arjuna (6-9 tahun), Bima (10-13 tahun) dan Yudhistira (14-17 tahun). Tiga jenjang ini dibuat bukan tanpa alasan, namun disesuaikan dengan Filosofi Sepakbola Indonesia (Filanesia) yang mengisyaratkan adanya fase kegembiraan sepakbola, pengembangan ketrampilan sepakbola dan pengembangan permainan sepakbola untuk pembinaan usia dini.

Mataram Utama Football Academy menggunakan pedoman Kurikulum Filosofi Sepakbola Indonesia (Filanesia), penerapan ilmu oleh pelatih-pelatih berlisensi serta dukungan fasilitas industri sepakbola modern yang memadai. Mengusung misi untuk bersama mewujudkan sepakbola Indonesia gemilang. Dari Jogja, kita bawa Garuda terbang tinggi.

Mataram Utama Football Academy juga menyiapkan tim untuk berkompetisi pada Piala Soeratin Kelompok Usia (KU) 13, 15 dan 17 tahun.